微量元素肥料的施用方法很多，有土壤施肥、种子处理和根外追肥等。

土壤施肥。即做基肥、种肥或追肥时把微量元素肥料施入土壤。这种施法虽然肥料的利用率较低，但有－定的后效。含微量元素的エ业废弃物和缓效性微肥常采用这种施肥方法。

种子处理。包括浸种和拌种两种方法。浸种时将种子浸入微量元素溶液中，种子吸收溶液而膨胀，肥料随水进入。常用的浓度是O.Ol％～O.l％，时间是l2～24小时。拌种是用少量水将微量元素肥料溶解，将溶液喷酒于种子上，搅拌均匀，使种子外面沾上溶液后阴干播种，－般每千克种子用2～6克肥料。

根外追肥。即将微量元素肥料溶液用喷雾器喷施到植株上，通过叶面或气孔吸收而运转到植株体内。常用的溶液浓度是O.Ol％～O.l％。

蘸秧根。这是水稻的特殊施肥法，其它需要移栽的农作物也可以采用蘸秧根的方法施肥。